2024年12月，国家发展改革委印发《水利中央预算内投资专项管理办法》，自印发之日起施行，有效期5年。原《国家水网骨干工程中央预算内投资专项管理办法》《水安全保障工程中央预算内投资专项管理办法》同时废止。
中央预算内投资支持规模根据项目投资、分类型支持比例统筹测算确定。现阶段支持领域和具体标准如下：
（一）重点支持领域。
包括蓄滞洪区建设工程、病险水库除险加固、大中型病险水闸除险加固等。
对东、中、西、东北地区，分别按照项目投资的60%、70%、80%、80%予以支持。小型病险水库除险加固工程，按照小(1)型500万元、小(2)型200万元的总投资基数，分省份打捆下达中央预算内投资，由地方统筹安排使用。
（二）防洪排涝工程。
包括江河防洪治理、重点区域排涝能力建设、海堤工程、水文基础设施等。
对东、中、西、东北地区，分别按照项目投资的50%、60%、70%、70%予以支持。江河防洪治理工程支持大江大河大湖干流，以及流域面积3000平方公里以上的重点中小河流（包含防洪关系紧密但流域面积不足3000平方公里的附属支流部分河段和回水段）。
（三）水生态治理工程。
包括水土保持、重点水生态治理工程等。
对东、中、西、东北地区，分别按照项目投资的40%、50%、70%、70%予以支持。建设内容不含水污染治理、水景观建设等。
中央直属项目，政府投资原则上由中央预算内投资全额安排。其他按照有关规定享受比照中部、西部地区投资政策的项目，经综合测算确定支持标准。
新建大中型灌区、大中型水库、大中型引调水，以及大型灌区改造提升等工程，由超长期特别国债资金支持，具体支持比例另行制定。